I 1832 brøt det ut borgerkrig i Portugal. Konflikten stod mellom Dom Pedro, tidligere konge av Portugal (som Dom Pedro I) og keiser av Brasil (som Dom Pedro IV). Han ville innsette sin datter Maria da Gloria som dronning etter at hennes onkel Dom Miguel hadde tatt makten og erklært seg selv som ny konge. Beleiringen av Porto varte i 1 år og dette ble sentralt for hele borgerkrigen mellom de 2 "kamphanene".
Resultatet for Porto sin del var en kraftig bybrann som startet i klosteret "San Fransisco" og den la det meste av byen i ruiner. Det eneste av klosteret som ikke ble skadet var en gamle kirken som fortsatt står på samme sted. Dom Pedro var seierherren og hans datter, Maria da Gloria, ble gjeninnsatt på tronen og som dronning Dona Maria II. Hun fikk 11 barn hvorav 2 senere ble konger av Portugal (Dom Pedro V og Dom Luis I). Hun døde i 1853 under fødselen av sitt 12 barn.
Men før hun kom så langt hadde hun donert restene etter det gamle nedbrente klosteret til bygging av en ny handel børs og en ny domstol for Porto. Før dette foregikk all handel under åpen himmel, men nå skulle det flyttes innendørs og til ærverdige lokaler - inspirert bl.a. av Crystal Palace i London. For å unngå økonomiske problemer under byggingen ble det vedtatt at alle varer som ble solgt skulle skattlegges ekstra i en periode på 10 år og at denne inntekten skulle gå til bygging av den nye børsen - "Palácio da Bolsa". Det må ha vært snakk og betydelige skatteinntekter for dette bygget er overdådig utsmykket. Det tok 70 år å få bygget helt ferdig.